自身免疫性疾病指由于自身免疫系统功能紊乱而引起机体攻击自身器官、细胞和组织的疾病，常见于类风湿性关节炎、多发性硬化症、银屑病等。集萃药康针对此开展了诸多小鼠模型的制作，包括银屑病模型、哮喘模型、关节炎模型、特应性皮炎模型、红斑狼疮模型、EAE（实验性自身免疫性脑脊髓炎）模型等，可用于相关疾病机制研究，助力治疗药物的开发。