小鼠需要细致的照料，舒适的居住环境有利于小鼠的健康生长。日常需加强对小鼠的观察，如小鼠状态、采食情况、笼盒干净程度等。
小鼠的饲养过程中需进行合笼和分笼操作。合笼指繁殖笼的形成，即一般雄鼠8周，雌鼠6周左右性成熟时，可进行合笼交配繁育。小鼠的妊娠期和哺乳期一般20天左右，19~21天可进行分笼操作，幼鼠离乳，即将雌雄小鼠分开饲养。
换笼操作，根据鼠笼饲养密度调整换笼频率，建议1-2周换一次笼。
繁殖笼盒在母鼠生产期前后需减少惊动，新生仔3天内不建议换笼，小鼠生仔的观察过程中尽量做到轻拿轻放，在观察过程中动作轻柔，避免惊吓母鼠及小仔，造成母鼠吃仔或仔亡。免疫缺陷模型类品系对病原体易感，对饲养环境的要求很高，推荐每周换笼一次。若未能确保环境的洁净度，肠道共生微生物可能会在免疫缺陷小鼠中引起病理变化。
糖尿病模型，因其多饮多尿的疾病特征，饲养期间小鼠笼盒较容易潮湿和脏，易对小鼠的健康状况产生影响，建议降低饲养密度、增加垫料更换频率，如一周2换或3换。
饲养方式，小鼠采用任食的方式饲养，日常需确保提供足够的食物，经常检查水和食的供应，保证小鼠能够正常获得水和食物（肥胖小鼠在找食物和水方面更困难，需特别注意）。为确保饲料和饮水的新鲜，每周添加或更换1-2次饮食。
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