Creリコンビナーゼを介したloxP遺伝子座の組換えは、トランスジェニック、遺伝子ノックアウト、遺伝子ノックインモデル動物で広く使用されています。遺伝子「はさみ」のように、このシステムは、イン・ビトロおよびインビボでDNAのさまざまな「切断」または「組換え」を効率的かつ便利に実行できます。Creリコンビナーゼに加えて、シザーマウスファミリーには、Flpo、Dreを介したFRTおよびRox遺伝子座の組換えも含まれています。