Cre/LoxPシステムは、Creリコンビナーゼを介したLoxP部位の組換えであり、トランスジェニック、遺伝子ノックアウト、遺伝子ノックインモデル動物で広く使用されています。遺伝子の「はさみ」のペアのように、体内および体外でDNAのさまざまな「切断」または「組換え」を効率的かつ便利に実行できます。このシステムを使用すると、特定の細胞、組織、または生物全体で、さらには特定の時間に特定の遺伝子をノックアウトまたは発現させて、特定の遺伝子に対する時空間的な特定の操作を実現することができます。Cre/LoxPシステムに加えて、リコンビナーゼシステムにはDre/RoxおよびFlop/FRTシステムも含まれます。