業務紹介

SNP（single nucleotide polymorphism, SNP）、即ち一塩基多型。ラットやマウスの遺伝的背景の年次モニタリング、ラット・マウス遺伝的変異や遺伝子汚染の有無の検出、さまざまな種類の変異ラットのバッチ検出によく使用されています。

薬康の優位性

ワンストップサービス：プライマー設計から成果物作製まで、ワンストップサービスで対応できます。

豊富な経験：ハイスループット検出プラットフォーム設立以来、累積検出データポイントが10万以上に達しました。

安定した遺伝子検出panel：13種類の近交系マウスの遺伝子検出および急速戻し交配マウスの背景検出用SNP　panelの開発に成功しました。

業務詳細

SNP（single nucleotide polymorphism, SNP）、つまり一塩基多型とは、主に、集団内で変異頻度が1%以上の一塩基の変化によって引き起こされる核酸配列多型を指し、一塩基の変換、トランスバージョン、挿入、欠失などを含んでいます。第三世代の遺伝子分子マーカーとして、SNPマーカー技術は、他の遺伝子マーカーと比較して、遺伝的品質モニタリングに関する優位性があり、例えば、分布が広く、遺伝的安定性が優れ、代表性があり、二対立遺伝子型を持ち、ハイスループットや自動化モニタリングを実現しやすいので、農業、医学、生命科学などの研究分野でますます多く使用されています。

当社はKASP技術を利用してSNPの正確な検出を実現し、以下のニーズを満たすことができます。

1.ラットおよびマウスの遺伝的背景の年次モニタリング：実験動物の年次遺伝的検出は、実験動物の品質評価および保証に不可欠な検出措置の一つであり、特に中核群については、定期的な遺伝的背景モニタリングが不可欠です。

2.ラットおよびマウスにおける遺伝的突然変異または遺伝的汚染の有無の検出：実験中に新しい表現型が現れた場合、またはマウスの交配が間違ったかどうかが不明な場合。

3.さまざまな突然変異マウスのバッチ検出により、InDels（挿入・欠失）の正確なタイピングが可能です。

BALB / cJバックグラウンドラインの遺伝子モニタリングサイトのKASPジェノタイピングマップ（例）

既知のSNP遺伝子座情報に基づく高スループットの競合的対立遺伝子特異的PCR（Kompetitive Allele Specific PCR，KASP）技術は、高感度蛍光検出に基づいており、さまざまなゲノムサンプル（複雑なゲノムDNAサンプルを含む）について、指定されたSNPおよびInDelsに対して正確な2対立遺伝子タイピングを行うことができます。この技術は、原理がTaqman検出に類似し、精度がゴールドスタンダードTaqmanと一致し、従来のTaqman技術とは異なり、ターゲット部位ごとに特定のプローブプライマーを合成する必要がなく、その独自のARM PCR原理により、ユニバーサル蛍光プライマーを使用して、すべての遺伝子座検出を最終的に増幅します。。最適化されたPCRシステムは、さまざまな遺伝子座でのハイスループット反応のニーズを満たすことができ、ゴールドスタンダードの精度を備えているだけでなく、実験コストを削減し、Taqmanよりも優れた遺伝子座適応性を備えています。

C57BL / 6Jバックグラウンドラインの遺伝子モニタリングサイトのKASPジェノタイピングマップ（例）

BALB / cJバックグラウンドラインの遺伝子モニタリングサイトのKASPジェノタイピングマップ（例）

業務プロセス：