SPF级实验动物屏障消毒常见方法为机械性清除、物理消毒法和化学消毒法。

　　1、机械性清除是用机械的方法清扫、洗刷、通风等清除病原体，是最普通和常用的方法。在SPF级实验动物屏障环境病原微生物控制上，机械性清除是控制病原微生物最基本的要求。但机械性清除法不能彻底对SPF级实验动物屏障环境病原微生物进行清除，但可减少病原微生物在屏障内的数量，属于辅助性消毒。

　　2、物理消毒是指利用物理因素杀灭或消除病原微生物及其他有害微生物的方法。SPF级实验动物屏障环境因自身条件要求限制，主要选用脉动真空高压蒸汽灭菌、紫外灯照射杀菌、钴-60辐照3种灭菌物理消毒方法。

　　3、化学消毒是指用化学消毒药物作用于微生物和病原体，使其蛋白质变性，失去正常功能而死亡。化学消毒是 SPF 级实验动物屏障最常用的消毒方法，化学消毒使用的化学药品溶液为消毒剂。消毒剂的使用方式包括喷洒、浸泡、擦拭、熏蒸等。目前，SPF 级实验动物屏障常用的有氧化消毒剂、碘类消毒剂、醛类消毒剂、酚类消毒剂、醇类消毒剂、季胺类消毒剂、卤素消毒剂等。

　　SPF级实验动物屏障实际生产的消毒方法应用中，理想的消毒方法应要求对安全、高效、稳定、低价位等特点进行综合考虑。