标记基因(marker gene)是一种能够起特异性标记作用的基因。通常用来检验重组DNA载体转化成功与否，或者检测目的基因在植物细胞或组织中的定位。常用的标记基因是一些抗生素抗性基因。

　　质粒上标记基因的功能：

　　标记基因是基因修饰小鼠的一种重要应用，通过基因敲入的形式，将外源的示踪基因敲入到内源基因中，从而可以对基因进行标记和示踪。

　　1、蛋白的亚定位：通过观察标记基因的定位确定内源蛋白的细胞亚定位;

　　2、蛋白的表达谱：对內源基因进行标记或者替代表达，通过观察标记基因的表达了解内源性蛋白的表达情况;

　　3、细胞的发育谱系：利用CRISPR/Cas9技术制备特定基因修饰的小鼠模型，与特定细胞基因敲入CreER的工具小鼠交配，在子代小鼠中使特定类型细胞被永久标记上荧光，便能通过观察这些被标记上的荧光信号来追踪某类特定细胞及其后代所有细胞的增殖、分化以及迁移等活动，为研究细胞命运及谱系提供有力手段。

　　基因工程的步骤分四步：

　　提取目的基因→目的基因与运载体结合→将目的基因导入受体细胞→目的基因的检测与鉴定。

　　标记基因必须具备以下4个条件：

　　①编码一种不存在于正常植物细胞中的酶;

　　②基因较小，可构成嵌合基因;

　　③能在转化体中得到充分表达;

④检测容易，并且能定量分析。

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